L'aeroporto è collegato alla stazione di Sestri Ponente Aeroporto grazie al servizio navetta circolare Flybus, con corse ogni 15 minuti. Il servizio navetta è operativo tutti i giorni dalle 6:00 alle 22:00. Si può utilizzare il servizio Flybus con un qualsiasi abbonamento AMT, con il biglietto ordinario rete urbana AMT (1,5 euro), il biglietto integrato AMT/Trenitalia (1,6 euro) e i biglietti turistici.